病毒性心肌炎

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TUhjnbcbe - 2021/6/29 2:26:00
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小雪已过,寒冬将至,在这个北风凛冽的时节,满心欢喜地约好友吃了一顿火锅,第二天嘴边冒出了亮晶晶的小水泡,学名疱疹。谈起疱疹病*,不仅我们害怕,鸡仔儿们更加恐惧,在秋冬之际,它们极易被疱疹病*ILTV(传染性喉气管炎病*)侵袭,感染后病死率竟然高达60%,让鸡场主们瑟瑟发抖。近期中国农业科学院哈尔滨兽医研究所李海课题组使用鸡细胞系DF-1和LMH为模型对这个ILTV病*进行了研究,通过对ILTV感染细胞系的整体转录组分析和代谢组分析,并结合一系列功能验证,探讨了ILTV的代谢需求。安诺优达为该研究提供了转录组测序服务~~

技术路线

研究路线

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ILTV感染细胞的转录组分析

为了探究LMH细胞和DF-1细胞中病*转录显著调控的分子机制,研究者对ILTV感染细胞系进行了整体转录组分析,分析发现在LMH细胞中没有ILTV感染改变的基因富集途径,在DF-1细胞中,表达下调基因被富集到与细胞代谢相关的通路,其中大部分下调基因参与了TCA周期相关的代谢过程,提示这些代谢过程可能是ILTV转录的关键。

图1.转录组分析

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DF-1细胞和LMH细胞在ILTV感染过程中的代谢组分析

根据转录组分析,研究者采用液相色谱质谱(LC-MS)非靶向代谢组学分析方法研究了在ILTV感染前后DF-1细胞和LMH细胞的代谢组动力学,分析表明ILTV感染倾向于促进代谢从糖酵解向脂肪酸(FA)和核苷酸生物合成的转变,并独立于谷氨酰胺分解而利用谷氨酰胺,对TCA周期没有显著的影响(图2)。

图2.ILTV感染诱导DF-1细胞重新合成脂肪酸

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糖酵解、谷氨酰胺、脂肪酸合成对LMH细胞ILTV感染的影响

研究者在ILTV允许细胞系LMH中详细研究了糖酵解、谷氨酰胺代谢和脂肪酸合成(FA)对ILTV感染的影响。研究者采用RT-PCR检测了相关基因的转录水平,确定ILTV复制的不同阶段需要不同的代谢途径。病*早期基因ICP4的转录和病*复制的后续步骤都需要葡萄糖和谷氨酰胺。然而,FA的合成对于ILTV组装是必要的,而对于ILTV复制的其他上游步骤不是必需的。

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DF-1细胞和原代细胞ILTV感染代谢需求的验证

为了确定在鸡细胞系中发现的ILTV感染的代谢需求也存在于原代细胞中,研究者在无特异性病原体(SPF)鸡胚中分离的原代细胞中进行了进一步验证,包括鸡胚肾细胞(CEK)和鸡胚肝细胞(CEL)。随后研究者使用表达增强绿色荧光蛋白EGFP的ILTV-LSJ09菌株监测CEK和CEL的病*感染,发现荧光只出现在非成纤维细胞样细胞中。与在充满培养基中培养的细胞相比,葡萄糖剥夺和谷氨酰胺剥夺均显著降低了ICP4的转录水平,并减少病*基因组复制和病*粒子的产生(图3)。

图3.DF-1细胞和原代细胞ILTV感染代谢需求的验证

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DF-1细胞和原代细胞ILTV感染代谢需求的验证

总的来说,ILTV感染倾向于促进代谢从糖酵解向FA和核苷酸合成的转变,并以独立于谷氨酰胺分解的方式利用谷氨酰胺,对宿主细胞的TCA周期没有明显的普遍影响。葡萄糖和谷氨酰胺都是转录病*基因和病*复制的后续步骤所必需的。然而FA的合成对于病*粒子的形成是必要的,而对于ILTV复制的其他上游步骤则不是必需的(图4)。据了解,目前该研究提供了第一个动物疱疹病*的全面性代谢概况,并阐明了ILTV代谢程序的主要特征,增加了目前对疱疹病*与宿主代谢相互作用的理解,并启发了该方向的进一步研究与探索。

图4.ILTV复制的代谢需求的推测模型

安诺基因在转录组测序方面拥有多样化的产品类型,涵盖了普通转录组测序产品,医学转录组测序产品、lncRNA测序产品、医学lncRNA测序产品、单细胞转录组产品、全转录组测序产品等,各类型产品均具有丰富的项目经验及物种经验,拥有专业的实验团队、分析团队以及领先的二代、三代测序平台,为大家提供高质量的测序服务,满足广大科研工作者们的研究需求,一切只为助力科研。

参考文献:

YangyangQiao,ZhitaoWang,ZongxiHan,etal.Globalexplorationofthemetabolicrequirementsofgallidalphaherpesvirus1[J].PlosPathogens,,August,24.doi.org/10./journal.ppat.

文案:产品经理段怡红

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